Да-да, не просите! Листать типовой устав бесполезно. Когда вы запрашиваете папку с учредительными документами и с умным видом погружаетесь в нее, вы показываете, что не знаете, с чего начать, и тратите свое время зря.
Просто следуйте моей методике и Вам вообще не потребуется смотреть учредительные документы.
Все, что Вам нужно на этом шаге -

Полная информация о компании находится в едином государственном реестре. Это общедоступные сведения. Привожу ссылки, где можно получить эту информацию бесплатно:

название компании, дата создания, вид деятельности, кто директор, кто учредители, какой юридический адрес, связи учредителя и компании, информация о судебных делах и бухгалтерская отчетность.

Теперь создайте у себя на компьютере папку "Внутренний аудит ООО "ХХХ" 20ХХ год" и сохраните туда бухгалтерскую отчетность за последние 3 года, которую вы нашли в открытых источниках. Эту отчетность уже можно использовать для анализа, если больше никакой информации нет. А еще она пригодится для того, чтобы сверить ее с балансом, который сдан в ИФНС, который вы возьмете из программы. Казалось бы, расхождений быть не должно, но это только на первый взгляд! В налоговую мог быть сдан уточненный баланс или вообще данные могут не совпадать с программой. В общем, приготовьтесь на всякий случай к любым сюрпризам!
Кстати, если отчетности нет в открытых источниках, это уже плохой сигнал (но учтите задержку, потому что отчетность публикуется обычно спустя год после сдачи).

Итак, в папку "Внутренний аудит..." мы в дальнейшем сохраним файлы с анализом отчетности, отчет о внутреннем аудите и любую другую дополнительную информацию, которой будем пользоваться во время проведения проверки.

Составление отчета обязательно! Не важно, делаете вы внутренний аудит для себя или для заказчика. Сразу ВСЕ записывайте, даже если Вам ВСЕ предельно понятно. Дело в том, что внутренний аудит предполагает работу с большим объемом информации, которая поступит в мозг за достаточно короткое время и также быстро будет потом забываться. Создайте файл "Отчет о проведении внутреннего аудита..." и начинайте писать, можно использовать мой шаблон.

Период, который мы будем охватывать внутренним аудитом, соответствует периоду возможной налоговой проверки - это 3 полных календарных года назад + часть текущего года.
Если компания существует меньше - Вам повезло!

Неправильные вопросы.
Не задавайте никому, особенно сотрудникам бухгалтерии, и особенно в устной форме, вопросов по каждой операции, которая вам показалась странной или непонятной. И вот почему:
1) погружение в детали отнимет у вас очень много времени и процесс может растянуться до бесконечности (а моя методика рассчитана всего на 1-3 рабочих дня)
2) почти всегда те вопросы, которые вы задали на первом этапе, в дальнейшем сами собой отпадут. Если же какие-то вопросы останутся, то вы будете их решать в спокойной обстановке после окончания внутреннего аудита.

У каждой организации есть своя специфика деятельности. Возможно, проводя внутренний аудит, вы столкнетесь в операциями, с которыми раньше никогда не сталкивались и не знаете, как правильно их учитывать.
Например, факторинг, лизинг, производство в общепите, платежи за услуги в адрес нерезидентов, учет технологических потерь, членские взносы некоммерческих организаций, валютный контроль... здесь может быть все, что угодно...

А сделаем мы это следующим образом. Выясните, какие справочные системы подключены в организации. Обычно об этом как-то забывают, но в любые тарифы справочных систем входят безлимитные письменные консультации экспертов.
Консультант-Плюс, Гарант, Контур-Норматив, Система Юрист, Система Главбух, даже 1С:ИТС (!!!) включают в свои тарифы такие консультации.
Обычно ответы не приходят в ту же секунду, а Вам и не нужно! Если в чем-то сомневаетесь - задайте вопрос письменно и двигайтесь дальше. Через какое-то время придет готовый ответ эксперта, а вы не потратите свое время на анализ информации.
Но даже если ничего не подключено, то даю ссылки на хорошие ресурсы, где можно задать вопрос бесплатно:

С вопросами разобрались, идем дальше...

На этом этапе, не углубляясь в детали, нужно выяснить, сдана ли в полном объеме вся отчетность, которая должна быть сдана по состоянию на сейчас.
Лучший источник для проверки - это доступ к программе для отправки отчетности: Сбис, Контур-Экстерн, Такском, 1С.

В некоторых сервисах можно сразу посмотреть отчет "Сдано-не сдано", но я Вам рекомендую составить файл в excel, в котором перечислить всю отчетность со сроками, по периодам, с указанием контролирующего органа, с отметками о сдаче/не сдаче, и ОБЯЗАТЕЛЬНО!!! сделайте отметки о наличии и количестве уточненных деклараций к каждому отчету.
Информация об уточненках нужна для того, чтобы когда мы приступим к анализу отчетности, не тратить время на анализ всех деклараций за один и тот же период. Если были уточненные, нас будет интересовать только последняя уточненка.

Посмотрите на образец такого файла:

Помните, что перечень отчетности для каждой компании индивидуален и зависит от налогового режима и объектов налогообложения.
Вы можете скачать мой шаблон и откорректировать его под особенности своей компании:

Вот пример такой таблицы:

Вот пример такой таблицы:

Если были НЕ принимаемые расходы, их нужно вынести в отдельную колонку.

Налог на прибыль сдается нарастающим итогом, НДС поквартально, этот момент нужно учитывать.
Если были отклонения, их нужно пояснить, налоговая обычно задает вопросы на эту тему.

Не всегда в рамках внутреннего аудита целесообразно проверять заработную плату и страховые взносы, так как этот процесс может занять достаточно много времени. Например, если главный бухгалтер принимает дела, а в штате есть человек на участке "Заработная плата", то проверку можно и отложить.
Чтобы не перегружать данную статью, я не буду подробно останавливаться на заработной плате, но дам полезные ссылки.
Видеоролик о том, как проверить заработную плату и составить сводную таблицу здесь.
Видеоролик о том, как составить 6-НДФЛ здесь, по этой же методике можно этот отчет и проверить.
Статья-справочник "Как принять на работу своего первого сотрудника" здесь (про кадровый учет и много других полезных материалов).
Как принять на работу иностранца здесь.

Из оборотно-сальдовой ведомости нужно последовательно перейти по всем счетам и по каждому счету:
1) посмотреть оборотно-сальдовую ведомость уже по каждому конкретному счету с аналитикой (что здесь, нет ли красных отрицательных остатков, что изменилось за период)
2) посмотреть анализ каждого счета

Вопросы и комментарии возникнут в процессе, возможно, вы увидите какие-то ошибки.
В любом случае, пройдя всю оборотку, хотя бы формально, вы можете быть уверены, что больше никаких сюрпризов нет.
Не забывайте записывать информацию в отчет, даже если видите, что всё хорошо.
Например,
"в оборотно-сальдовой ведомости по счету 62 в разрезе субсчетов остатки учтены корректно"
или
"ведется не правильный учет в разрезе аналитики (договоры) на счете 76.АВ: НДС с авансов начисляется с аналитикой "Поступление на расчетный счет...", а принимается к вычету с аналитикой "Счет-фактура выданный..." Данная проблема есть в начальных остатках на начало 1 квартала 2020 и сохраняется до текущего момента".
Если нужно что-то уточнить, тоже это запишите.
И не забывайте отправлять вопросы экспертам, если в чем-то сомневаетесь.

Однако, в реальной жизни я такого ни разу не встречала. Поэтому я приведу Вам свои рекомендации, которые наиболее часто встречаются в отчетах о проведенном внутреннем аудите.